2019-04-15から1日間の記事一覧

pyTFAとmatTFA: 熱力学に基づく流束解析のための python パッケージと MATLAB ツールボックス

pyTFAとmatTFAは、オリジナルのTFA論文の最初の公開実装。具体的には、ギブスエネルギーと代謝物濃度の明確な定式化が含まれる。これにより、代謝産物濃度測定の直接的な統合を可能にする。 ハイスループット分析技術は、使用できる豊富なオミクスデータを提…

計算代謝工学戦略の特徴付けとランキング

Characterizing and ranking computed metabolicengineering strategies Schneider and Klamt https://academic.oup.com/bioinformatics/advance-article/doi/10.1093/bioinformatics/bty1065/5288513 Bioinformatics, 2019, 1–10doi: 10.1093/bioinformatic…

「Gibbsエネルギー散逸の上限が細胞代謝を支配する」

An upper limit on Gibbs energy dissipationgoverns cellular metabolism https://www.nature.com/articles/s42255-018-0006-7Nature metabolism, vol1, Jan, 2019, 125-132.Niebel et al.,細胞の代謝機能を支配する原理は良くわかっていない。多様な生物が…